La Sección Sindical es el conjunto de trabajadorxs de una misma empresa o centro de trabajo que pertenecen al sindicato CNT. Las Secciones Sindicales que se constituyan gozan de una cierta autonomía y no se pueden presentar a Elecciones Sindicales, hecho que diferencia a CNT de la mayoría de Sindicatos constituidos legalmente en el Estado español.

En Álava estan formadas las siguientes Secciones Sindicales:

Sección Sindical de CNT del CGP Admin Euskadi

Sección Sindical de CNT en Talleres Aratz

Sección Sindical de CNT en la empresa Tecnología Cerramientos Aluminio (TCA)